حمل مركز الشهاب لحقوق الإنسان السلطات مسؤولية وفاة الرئيس المصري  محمد مرسي، وطالب بتحقيق دولي عاجل في ظروف وملابسات احتجازه ووفاته، كما طالب المركز بوقف الإهمال الطبي في السجون المصرية، ومراعاة حقوق الإنسان.

وتعرض الدكتور مرسي تعرض لنوبة إغماء توفي على إثرها خلال جلسة محاكمته في قضية التخابر مع حركة حماس، حيث طلب الكلمة من القاضي، وقد سمح له بالكلمة والتي تحدث فيها عن الاهمال الطبي المتعمد وعقب ذلك أُصيب بنوبة إغماء توفي على أثرها.

وحذر مركز الشهاب عدة مرات، من الانتهاكات التي يتعرض لها الرئيس المصري السابق، والقتل البطيء الذي تعرض له منذ احتجازه عام 2013، وأدان المركز ظروف الاحتجاز السيئة التي تسببت في تدهور حالته الصحية، بالإضافة لمنعه من الزيارة والدواء ومنعه من العرض على الطبيب.