ادعت وسائل إعلام الانقلاب العسكري،  سيطرة  جماعة الإخوان المسلمين على وزارة التربية والتعليم، واختراق الكثير من الموظفين الإخوان للوزارة، مما يشير إلى استعداد الوزارة لمجزرة وسط الموظفين والتخلص من الكثير منهم، لتستر على فشل سلطة الانقلاب العسكري في إدارة امتحانات الثانوية العامة.

ونشرت الكثير من وسائل الإعلام المحسوبة على نظام قائد الانقلاب السيسي الكثير من التقارير التي تتحدث عن اختراق الإخوان للوزراة، حيث نشرت صحيفة البوابة نيوز التي يرأس تحريرها عبد الرحيم على، المقرب من جهاز الأمن الوطني، أمن الدولة سابقًا، تقريرًا يتحدث فيه عن تعيين ما يفوق 350 شخصًا في عهد الرئيس المنتخب محمد مرسي.

وأشار التقرير الذي جاء على لسان مصادر، إنه تم توزيعهم على الإدارات التعليمية المختلفة، ومنهم قيادات داخل وزارة التربية والتعليم وداخل هيئة الأبنية التعليمية، مشيرة إلى أن هذه العناصر كانت مهمتها إرسال تقارير أولاً بأول لمكتب الإرشاد، عن تفاصيل الوزارة، وما زالت هذه العناصر مستمرة في عملها، بل وبعضهم يشارك في مظاهرات الإخوان، وتتستر عليهم الوزارة، على حد قول المصادر.

أكد مقدم البرامج عزمي مجاهد، أن وزارة التربية والتعليم، والصحة والزراعة وبعض النقابات، ممتلئة بالخلايا الإخوانية النائمة، مطالبًا الدولة بمعرفة هؤلاء الموظفين الإخوان وضربهم بالنار.

وأضاف مجاهد خلال مداخلة هاتفية ببرنامج "عيون مصر"، المذاع عبر فضائية "الحدث" الإخبارية، أن رئيس الوزراء تأخر كثيرًا في قرار ذهابه إلى وزارة التربية والتعليم، مؤكدًا أنه يوجد خلايا إخوانية نائمة فى مصر للطيران ووزارة الزراعة والصحة، وأن هذه الخلايا معروفة.

بينما قال مقدم البرامج محمد الغيطي، إن جماعة الإخوان تقف وراء صفحة "شاومينج" الشهيرة بتسريب امتحانات الثانوية العامة، مضيفًا أنه يمتلك دلائل على تسريب امتحان اللغة العربية فجر يوم الامتحان، وهو ما تنفيه وزارة التربية والتعليم.

قال متصل يدعى "فتحي"، لبرنامج "على مسؤليتي" إن لديه أدلة بالصوت والصورة تثبت أن المسؤول عن صفحة "شاومينج " على الفيس بوك، التى تسرب امتحانات الثانوية العامة "إخواني".